依据相关法律的规定,工程合同纠纷按照不动产纠纷确定管辖,而不动产纠纷属于专属管辖,所以工程款纠纷属于专属管辖。根据《民事诉讼法》规定，下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：
1.因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖;
2.因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖;
3.因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。
【法律依据】
《民事诉讼法》第三十四条，下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：
(一)因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖;
(二)因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖;
(三)因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。
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